?#38431;?#35775;问广州艾基生物技术有限公司官方网站 !
首页 > 科研服务> Sanger测序平台> >真菌 ITS 区序列分析

真菌 ITS 区序列分析

真菌 ITS 区序列分析


服务介绍  Service Introduction


      真菌基因组中编码 rRNA 的基因有 4 种,28S rDNA、5S rDNA、18S rDNA 和 5.8S rDNA,其中 18S、 5.8S 和 28S rDNA 基因组成一个转录单元,其间的间隔区为 ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括 ITS1 及 ITS2 两部分。ITS 区基因进化速度快, 具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。利用 rDNA 的保守序列设计引物,PCR 扩增未知真菌的 ITS 区,测序后与 GenBank 中已知的序列进?#22411;?#28304;性比较,将未知真菌鉴定到属或种。


技术流程 Technical Procedures


技术流程图

ITS.jpg


图4.png

ITS 示意图 


样品要求及注意事项 Sample Requirements And Notes 


  kyfwtx.png 基因组 DNA:OD 260/280 在 1.8-2.0 之间(OD260/230 最好大于 1.5),浓度 ≥ 30 ng/μl, 体积 ≥ 20 μl,且无明显降解; 

  kyfwtx.png 建议提供培养过的菌液,体积 >2 ml,请确保提供的菌液是经过分离培养的单菌落,因样本不纯造成的测序双峰,将全额收取实验费用;

  kyfwtx.png 特殊样品 , 如酵母菌、丝状真菌等,建议提供基因组 DNA;

  kyfwtx.png 不接受有致病性的样品 , 如果菌体带有致病性,请提供菌体的基因组 DNA,并进行加热处理以杀死致病菌;

  kyfwtx.png 由于有些真菌形态与细菌相似,难以判断,在无法获得 ITS结果?#20445;?#24314;议考虑进行真菌16S区序列分析; 

  kyfwtx.png 对于测序双峰的样本,我们可以提供克隆测序的服务。


交付结果  Results Delivery


  kyfwtx.png 测序峰?#25216;?#24207;列文件 

  kyfwtx.png ITS 序列拼接文件 

  kyfwtx.png 序列分析比对结果


服务价格 Pricing Information




blob.png

对于测序双峰的样品,我们可提供克隆测序服务,价格:300 元 / 样品; 包含:片段克隆,4 个阳性克隆测序,序列比对分析。


IGE-真菌菌种鉴定委托书.doc



?#35753;?#31185;研服务
020-89053723
广州艾基生物技术有限公司
邮箱:[email protected]
QQ:1787730693
地址:广州国际生物岛螺旋三路12号三期四栋301

版权所有 ? 广州艾基生物技术有限公司粤ICP备15007216号   技术支持:道顺科技

微信服务号

1.3125s
北京快乐8数据下载