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细菌 16S 区序列分析

细菌 16S 区序列分析


服务介绍  Service Introduction


          细菌的 rRNA 是细胞内含量最多的 RNA,约占 RNA 总量的 80% 以上,由高度保守区和可变区组成。

        细菌的 rRNA 包括 5S、 16S、 23S,其中 5S rRNA 信息量少,不适合分析。23S rRNA 尽管分子大,信息量多,但碱基突变速度较快,同样不适用于细菌鉴定。16S rDNA 是编码原核生物核糖体小亚基 16S rRNA的 DNA 序列,相比之下遗传较为稳定,长度在 1550±200 bp 左右,信息量适中,可以用于研究系统进化。目前已经报道了 10,000 种以上的细菌 16S rDNA 序?#23567;?/span>


技术流程 Technical Procedures


技术流程图

流程图2.png


流程图3.png

16s rDNA 示意图 

样品要求及注意事项 Sample Requirements And Notes 


   kyfwtx.png 基因组 DNA:OD 260/280 在 1.8-2.0 之间(OD260/230 最好大于 1.5),浓度 ≥ 30 ng/μl, 体积 ≥ 20 μl,且无明显降解; 

  kyfwtx.png 建议提供培养过的菌液,体积 >2 ml,请确保提供的菌液是经过分离培养的单菌落,因样本不纯造成的测序双峰,将全额收取实验费用;

  kyfwtx.png 特殊样品 , 如放线菌、厌氧菌等,请直接提供基因组 DNA,革?#38469;?#38451;性菌,建议提供基因组 DNA;

  kyfwtx.png 不接受有致病性的样品 , 如果菌体带有致病性,请提供基因组 DNA,并进行加热处理以杀死致病菌;

  kyfwtx.png 由于有些真菌形态与细菌相似,难以判断,在无法获得 16S rDNA 结果?#20445;?#24314;议考虑进行真菌 ITS 区序列分析; 

  kyfwtx.png 对于测序双峰的样本,可以提供克隆测序的服务。


交付结果  Results Delivery


  kyfwtx.png 测序峰?#25216;?#24207;列文件 

  kyfwtx.png 16S rDNA 序列拼接文件 

  kyfwtx.png 序列分析比对结果


服务价格 Pricing Information


价格2.png

* 对于测序双峰的样品,可提供克隆测序服务,价格:300 元 / 样品; 包含:片段克隆,4 个阳性克隆测序,序列比对分析。


IGE-细菌菌种鉴定委托书.doc




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