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艾基人源细胞STR鉴定


据统计约30%细胞系被交叉污染或错误辨识,因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重?#30784;?#20020;床细胞治疗灾?#30740;?#21518;果……这浪费大量时间、精力和金钱。

因此近年NIHATCCNatureScience等对此多次发出呼吁,要求研究者对细胞进行鉴定,如2011年美国国家标准学会专门颁?#21058;?#19968;份细胞STR鉴定国家标准;2014 12 ?#38534;?/span>2015 2 Science 杂志分别发表文章专题阐述细胞交叉污染和错误辨识严重性;2015 Nature通知:Nature 旗下杂志将从月开?#23478;?#27714;作者鉴定论文中所用细胞系;20156月有报道称一科学家由于用错细胞系,撤销Nature论文。STRShort Tandem Repeat,短串联重复序列)基因?#20013;?#24050;被ICLACATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定,目前越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR?#20013;?#25968;据。

?#35745;?.png 

STR基因位点由长度为37个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹(如目前我们亲子鉴定即采?#37238;?#25216;术),其可通过PCR(聚合酶?#35789;椒从Γ?#26469;检测。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷?#35789;?#30340;不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,?#32431;?#26681;据所得的STR?#20013;?#32467;果与专业的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。

一、?#38382;?#38656;做细胞STR鉴定 

  1、发表文章或申请课题经费前;

  2、使用细胞进行临床治疗(试验)前;

  3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞;

  4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束?#20445;?/span>

  5、新得到的细胞或实验室培养5代以上的细胞;

6、细胞系表?#26893;?#31283;定或结果与预期差别较大;

二、已开?#23478;?#27714;细胞STR鉴定的期刊: 

Nature;

BioTechniques;

Cancer Research;

Cancer Discovery;

Clinical Cancer Research;

Molecular Cancer Research;

Cancer Prevention Research;

International Journal of Cancer;

Molecular Cancer Therapeutics;

Cell Biochemistry and Biophysics;

Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;

In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal;

......

三、细胞STR鉴定,艾基更专业:

专业化团队:积累了近5年的亲子鉴定的?#25163;?#21644;?#19990;?#25317;有细胞生物学专业服务队伍,专业解读细胞STR数据;

专业的结题报告:出具中/英文结题报告书(含STR?#20013;屯计?#21450;搜库鉴定结果);

高准?#33539;齲?/span>符合最新ANSI/ATCC标准,测试结果99.99%与文献吻合;

标?#25216;?#27979;与?#27835;?/span>ABI 31303730基因?#27835;?#20202;和GeneMapper数据处理软件;

多基因检测、高灵敏度:可同时检测21STR位点,仅需2ng DNA?#32431;?#21028;断细胞类型及可能的细胞交叉污染;

常用的21STR位点名称:

D5S818

D13S317

D7S820

D16S539

VWA

TH01

TPOX

Amelogenin

(性别位点)

CSF1PO

D3S1358

Penta E

D2S441

D2S1338

Penta D

D10S1248

D19S433

D21S11

D18S51

D6S1043

D8S1179

D12S391

FGA

快速交付148个样?#26041;?#38656;35个工作日、4996个样本仅需47个工作日;

高?#32422;?#27604;:高竞争力的服务价格和完善的售后技术支持服务。

四、艾基细胞STR鉴定服务项目:

人源细胞STR?#20013;?#26816;测;

/鼠细胞交叉污染检测;

组 1.png五、艾基细胞STR鉴定服务流程:

 

 

 

 


六、常见问题解答:

1、请问做细胞STR鉴定有何用?

答:细胞STR鉴定主要应用于将人源细胞用于研究、生产的?#31361;В?#21253;括但不限于以下领域:医学、遗传学、药物开发、疫苗研制、生物技术和制药行业、再生医学、干细胞、肿瘤、免疫细胞治疗、病毒检测和治疗及基础细胞生物学等,通过细胞STR鉴定,您可以:

<1>. 判断您培养的该细胞是否被其他细胞交叉污染及其可能被污染的细胞名称;

<2>. 明?#20998;?#36947;?#32422;?#27491;在使用的细胞是否“正确”——2015年有文献报道称:国内建立的人源细胞系竟有高达85.51%是错的

 

2、若我需要鉴定的细胞没有文献报道有STR数据,请问还能做STR鉴定吗?

答:尽管我司建立的STR数据库有目前最全的人源细胞系STR数据,但有些文献未报道STR数据的细胞系(国内自行建立的细胞系)在我们数据库中可能也没有其STR数据。不过,我们仍建议您进行细胞STR鉴定,因为通过该项检测,您可以:

<1>. 判断您培养的该细胞是否被其他细胞交叉污染及其可能被污染的细胞名称;

<2>. 您将是第一个得到该细胞系STR数据(DNA指纹)的人;

<3>. 该细胞系的STR数据将保存在我们数据库中,方便您以后调用、比对。

 

3、我的研究结果发不了《Nature》,请问还有必要做细胞STR鉴定吗?

答:只要您使用细胞从事相关研究工作,我们强烈建议对您的细胞进行鉴定,原因如下:

<1>. 2015年有文献报道称:国内建立的人源细胞系竟有高达85.51%是错的!!!

<2>. 目前不止《Nature》需要细胞鉴定结果,很多杂志也陆续要求投稿者提供细胞鉴定数据;

<3>. 退一万步说,?#35789;?#25105;们使用细胞的?#24247;?#19981;是?#32654;?#21457;表文章,如因为我们使用了“错误”的细胞或者被其他细胞污染的细胞,而导致得出不可?#24247;?#23454;验结论,那多年的?#37327;?#23682;?#35805;追选?#21487;惜?如2014年炒得沸沸扬扬的日本美女科学家小保方晴子的STAP细胞?#24535;紓?#21518;来证实是污染了胚胎干细胞。

 

4、请问该如何?#33073;?#27979;试?

答:为保证样品质量和STR鉴定效果,我们不建议?#31361;?#30452;接送检?#32422;?#25552;取好的基因组DNA推荐?#31361;?#30452;接寄送细胞沉淀,方法:用PBS将细胞洗2遍后,收集细胞于一干净无菌离心管中,离心、去上清,即得细胞沉淀(细胞数≥106个,细胞沉淀应至少肉眼明显可见),用封口膜封?#32654;?#24515;管管口以防止样品泄漏及其他细胞污染。样品随冰袋寄送到我司?#32431;傘?/span>

 

5、请问贵司可以进行人干细胞系鉴定吗?

答:可以。目前我司的细胞系STR数据库包含2000来株人胚胎干细胞、hiPSCs、间充质干细胞系STR数据

 

6、请问贵司的项目周期为多长?

答:148个样品,在确认收到样品及相应款项后35个工作日内完成鉴定;4996个样品,在收到样品及相应款项后47个工作日内完成鉴定工作。


九、参考文献:

 

1. Reid, Y.A., Characterization and authentication of cancer cell lines: an overview.Methods Mol Biol, 2011. 731: p. 35-43.

2. Capes-Davis, A., et al., Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines.Int J Cancer, 2010. 127(1): p. 1-8.

3. Chatterjee, R., Cell biology. Cases of mistaken identity.Science, 2007. 315(5814): p. 928-31.

4. Lorsch, J.R., F.S. Collins, and J. Lippincott-Schwartz, Cell Biology. Fixing problems with cell lines.Science, 2014. 346(6216): p. 1452-3.

5. Neimark, J., Line of attack.Science, 2015. 347(6225): p. 938-40.

6. Zhao, M., et al., Assembly and initial characterization of a panel of 85 genomically validated cell lines from diverse head and neck tumor sites.Clin Cancer Res, 2011. 17(23): p. 7248-64.

7. Masters, J.R., Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines.Nature, 2012. 492(7428): p. 186.

8. McLaren, R.S., Y. Reid, and D.R. Storts, Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines.Methods Mol Biol, 2013. 963: p. 341-53.

9. Announcement: Time to tackle cells’ mistaken identity.Nature, 2015. 520(7547): p. 264-264.

10. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup, A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end.Nat Rev Cancer, 2010. 10(6): p. 441-8.

11. Editorial, It is time for all involved to tackle the chronic scandal of cell-line contamination. Funders first.Nature, 2009. 457: p. 2.

12. ANSI/ATCC, Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. 2011, ASN-0002-2011.

13. Masters, J.R., et al., Short tandem repeat profiling provides an international reference standard for human cell lines.Proc Natl Acad Sci U S A, 2001. 98(14): p. 8012-7.

14. Edwards, A., et al., DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats.Am J Hum Genet, 1991. 49(4): p. 746-56.

15. Sorensen, T., A Method of Establishing Groups of Equal Amplitude in Plant Sociology Based on Similarity of Species Content and Its Application to Analyses of the Vegetation on Danish commons.Biol Skr, 1948. 5: p. 1-34.

16. Ye, F., et al., Genetic profiling reveals an alarming rate of cross-contamination among human cell lines used in China.FASEB J, 2015. 29(10): p. 4268-72.

 



资料下载:广州艾基生物技术有限公司 细胞STR株鉴定委托书.doc



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